Объект исследования: сыворотка и гемолизаты крови крупного рогатого скота и овец. С помощью молекулярно-генетических маркеров крови изучена внутрипопуляционная изменчивость. Вычислены показатели иммуногенетических дистанций. Проведена таксономическая оценка микроэволюционной взаимосвязи. Установлена степень генетической дифференциации пород, принимавших участие в формировании генофонда аулиекольской мясной породы скота. Отмечена возможность проведения селекции по линиям, имеющим маркерные гены. Изучена генетическая структура генофонда овец каракульской и казахской тонкорунной пород по молекулярно-генетическим маркерам крови.