Разработка высокочувствительных молекулярно-биологических, биохимических тестов детекции патогенов, влияющих на потребительские качества конечного продукта, на основе мониторинга возбудителей заболеваний сельскохозяйственных культур
Руководитель проекта: Искаков Булат Кудайбергенович
Исполнители проекта:
Организация: Республиканское государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина"
Инвентарный номер: 0222РК00307
Регистрационный номер: 0121РК00783
Ключевые слова: 18S рРНК,Fusarium spp.,β-глюкан,вирусы картофеля,иммуноферментный анализ,М вирус картофеля,мультиплексная ПЦР,полимеразная цепная реакция,фузариоз
1) Проведена диагностика присутствия пяти вирусов методом ИФА и мультиплексной ОТ-ПЦР в растениях картофеля 18-и сртов. Участки генома местных изолятов PVS, PVM, PVY клонированы и секвенированы, проведен филогенетический анализ. Разработан регламент.
2) Оптимизированы условия синтеза и очистки сериновых протеаз Fusarium spp. Определены физико-химические свойства ингибиторов протеаз пшеницы. Разработан тест и проведен скрининг сортов пшеницы на содержание ингибиторов сериновых протеаз.
3) Проведено фитопатологическое обследование дикоплодовых лесов и посадок яблони в Алматинской области (106 образцов). Получен 21 изолят E. Amylovora, проведено их генотипирование (все отнесены к архетипному генотипу А). Выпущены рекомендации.
4) Разработан способ оценки уровня фрагментации 18S рРНК растений. Проведены полевые испытания (картофель и пшеница). Установлено, что при вирусном и фунгальном поражении усиливается образование трех фрагментов 18S рРНК. Разработан регламент.
5) Проанализировано 50 сортов пшеницы, 50 сортов ячменя и 50 сортов овса для выявления генов, ответственных за синтез β-глюкана. Определено содержание β-глюкана в отобранных сортообразцах злаковых культур. Создана коллекция геномной ДНК образцов.