Разработка отечественной высокоэффективной системы диагностики вирусных инфекций сельскохозяйственных культур на основе молекулярных тестов.
Full Name of the work head: Гриценко Диляра Александровна
Исполнители проекта:
: Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Inventory number: 0222РК00134
Registration number: 0121РК00756
Keywords: Вирусы растений,ПЦР-анализ,Сельскохозяйственные культуры,Система обнаружения вирусов,Фитопатогены
Был проведен биоинформатический анализ геномов и геномных регионов 5 вирусов яблони, 3-х вирусов винограда, 3 вирусов малины, 5 вирусов картофеля, 2-х вирусов томата и 2-х вирусов пшеницы. Были выявлены высококонсервативные регионы геномов для каждого вируса. Были разработаны высокоспецифичные праймеры для детекции 20 исследуемых вирусов. Для каждого вируса было проведено клонирование амплифицированного целевого региона в плазмиды для разработки положительных контролей. Мультиплексные тест-системы сформированы и апробированы на положительных контролях, а также растительном материале. Работоспособность каждой тест-системы была подтверждена коммерческими наборами для изучаемых патогенов, а также секвенированием целевых регионов геномов вирусов. Была проведена детекция 20 исследуемых вирусов в 718 растительных образцах шести культур. В генбанк NCBI было загружено 2 последовательности капсидного белка для вируса RLMV - MZ419348.1 и MZ419347.1.