Жетекшінің аты-жөні, тегі: Сапахова Загипа Бейсеновна
Work head:
: Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Инвентарлық номер: 0322РК00120
Тіркелген номер: 0122РК00097
негізгі сөздер: гены,молекулярные маркеры,направленная селекция,ризомания,сахарная свекла,устойчивость
Были выполнены работы по биоинформатическому анализу генома вируса BNYVV с выявленем порогов вариабельности каждой геномной молекулы РНК для разных штаммов, расположенных в международном генетическом банке NCBI. Вариабельность РНК1 составила 1-4%, РНК2- 5-6%, РНК3- 3-4% и РНК4 – 1-3%. Наибольшей консервативностью внутри вида и вариабельностью за пределами вида обладали ген капсидного белка, ген РНК зависимой РНК-полимеразы и р42. Были разработаны 3 набора праймеров для гена капсидного белка, РНК-зависимой РНК-полимеразе и р42 гена, для каждого гена в отдельности. На геномной РНК3 был выявлен регуляторный регион, а именно промотерный регион гена р25, обладающий вариабельными позициями, а также регион TGB на РНК2 для идентификации штаммов А и В. Для идентификации штамма Р вируса, праймеры были разработаны к гену, кодирующему р26 белок, последовательности геномной РНК5.
Было проведено обнаружение вируса BNYVV в 290 образцах сахарной свеклы, 15 образцов были инфицированы вирусом. С помощью разработанной тест-системы обнаружения вируса BNYVV, основанной на ОТ-ПЦР, были идентифицированы B и P штаммы на полях сахарной свеклы Алматинской области. Работы по секвенированию целевых геномных регионов штаммов В и Р для выявления генетического родства с известными изолятами в мире будут продолжены в соответствии с календарным планом. Работы по молекулярно-генетическому мониторингу вируса сахарной свеклы в Казахстане проводятся впервые.