Были продолжены работы по сбору 100 охарактеризованных образцов от пациентов с установленным диагнозом COVID-19 из регионов и городов Казахстана на протяжении 2021-2022 годов. За отчётный период 2022 года нами были секвенированы 51 образцов вируса SARS-CoV-2 на платформе MiSeq и 90 образцов вируса SARS-CoV-2 на платформе Oxford Nanopore Technologies. В общей сложности были получены 141 полногеномных последовательностей вируса SARS-CoV-2 с длинами геномов не менее 29300 п.н. выделенных на территории Казахстана в 2022 году. Полученные данные были депонированы в базе GISAID под инвентарными номерами: EPI_ISL_13612374–EPI_ISL_13822847 и EPI_ISL_15727564–EPI_ISL_15727653. Согласно системе классификации Nextstrain, циркулирующие генотипы представлены вариантом Omicron – 141 образец (клада 21K – 84 образца, клада 21L – 17 образцов, клада 22В – 40 образцов).Согласно системе классификации Pango, доминирующие генотипы были представлены линиями BA.1.1 (75 образцов), BA5.2 (30 образцов) и BA.2 (17 образцов). Остальные генотипы были представлены линиями: BA.5.1 (7 образцов), BA.1.1.15 (6 образцов), BA.1, BA.5.2.1 и BA.5.8 (по 2 образца), BA.1.15 и BE.1 (по 1 образцу).