Проведено выделение РНК из нормальной и опухолевой тканей пищевода для образцов 004T, 004N, 015T, 015N, 016T, 016N, 018T, 018N. Качественная и количественная характеристика общей РНК проводилась несколькими методами: а) спектрофотометрически; б) флуорометрически. Уровень экспрессии генов MUC5B, TNXB, MMP3 и MAGEB2 в образцах 008T, 008N, 009T, 009N оценивали при помощи количественной PCR (RT-PCR) в режиме реального времени по технологии TaqMan на амплификаторе Real-Time CFX96. Восемь пар праймеров (4F3-R4, 4F3-R5, 4F4-R1, 4F4-R2, 4F5-R1, 4F5-R2, 5F2-R1, 5F1-R2) были отобраны для идентификации fusion-генов в опухолевых тканях с помощью ПЦР-амплификации и детекции в агарозном геле. Согласно протокола производителя TruSeq RNA Sample Preparation подготовлены библиотеки РНК для дальнейшего секвенирования на платформе Illumina MiSeq System. Проведено таргетное профилирование некодирующих РНК опухолевых образцов с помощью технологий секвенирования нового поколения. Проведена идентификация различных типов малых РНК в опухолевых тканях казахстанских пациентов с раком пищевода с применением методов биоинформатики. Анализ проведен согласно оптимизированному и установленному протоколу COMPRSA. Проведено применение Метода Независимых Компонент и рассчитаны независимые компоненты для выборочных наборов транскриптомов рака пищевода (GSE38129, GSE20347, GSE33426, GSE45670, GSE161533) в программной среде BIODICA.