Палеогенетический анализ патогенных микроорганизмов в археологических останках человека, представляющих Центрально-Евразийский регион
Руководитель проекта: Джансугурова Лейла Булатовна
Исполнители проекта:
Организация: Республиканское государственное предприятия на праве хозяйственного ведения «Институт генетики и физиологии» Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан
Инвентарный номер: 0222РК00390
Регистрационный номер: 0120РК00206
Ключевые слова: генетика микроорганизмов,древняя ДНК,палеогенетика,патогенные микроорганизмы,секвенирование нового поколения
Выделены образцы палео-ДНК 360 древних индивидов с, территории современного Казахстана, России и Кыргызстана, проведено высокопроизводительное секвенирование, проведен биоинформатический скрининг ДНК древних патогенных организмов, определены индивидуальные спектры патогенов. Впервые установлено, что самыми распространенными патогенами древнего мира эпохи бронзы и железного века были микроорганизмы, вызывающие кариес, заболевания десен и других мягких тканей ротовой полости. Отмечены такие паразитарные заболевания, такие как гельминтоз, сальмонеллез, брюшной тиф. Такие опасные заболевания, как гепатит B (HBV), чума (Yersinia pestis), сальмонеллез (Salmonella enterica) выявлены только у единичных индивидов. Проведено детальное исследование древних штаммов HBV и Yersinia pestis. В структуре штамма Y. pestis из некрополя Кызыл впервые установлены обширные делеции, ослабляющие его патогенность. Новым открытием является то, что средневековые штаммы Y. pestis из несторианского кладбища Караджигач являются генетическими предшественниками «Черной смерти» (второй пандемии чумы в Европе).