Исследования проводились на акватории и водосборных площадях 10 водоемов Щучинско - Боровской системы озер: Улькен Шабакты, Киши Шабакты, Шортан, Боровое, Текеколь, Майбалык, Сулуколь, Жукей, Карасье и Катарколь. Выявлены причины снижения уровня воды в озерах как за счет влияния естественных факторов, в том числе изменения климата, так и за счет антропогенного воздействия. Приведены ряд рекомендаций по улучшению экологической обстановки в озерах. Важным результатом исследования является оценка дефицита водных ресурсов и рекомендации по объему воды, который дополнительно следует перебросить в озера для стабилизации уровней воды в них.