Биологическая и генетическая характеризация опасных патогенов дикой фауны
Full Name of the work head: Сансызбай А.Р.
Исполнители проекта: Султанкулова К.Т., Червякова О.В.
: Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности
Inventory number: 0214РК02086
Registration number: 0114РК00099
Keywords: Ген*секвенирование*филогенетический анализ*вирусы*генетика вирусов*бешенство*болезнь Ньюкасла
Выбраны значимые участки вирусных геномов для секвенирования и филогенетического анализа. Проведен подбор и синтез праймеров для амплификации и секвенирования выбранных участков вирусных геномов. Методом обратно-транскриптазной ПЦР амплифицированы участки геномов вирусов болезни Ньюкасла и бешенства. Определены нуклеотидные последовательности участка F-гена изолятов вируса болезни Ньюкасла. На основании нуклеотидной последовательности участка F-гена исследуемого изолята вируса болезни Ньюкасла проведены сравнительный анализ с использованием международной базы данных генов GenBank и филогенетический анализ с использованием программного обеспечения Mega6.06. Определены нуклеотидные последовательности участков G и N-генов изолятов вируса бешенства, выделенных в текущем году. Проведен сравнительный и молекулярно-генетический анализ G и N-генов изолятов вируса бешенства с использованием международной базы данных генов GenBank. Проведен филогенетический анализ изолятов вируса бешенства с использованием программного обеспечения Mega6.06 и определен филогенетический клайд и суб-клайд для каждого исследуемого изолята на основании сравнения со штаммами известных генотипов.