Описан и проанализирован флористический состав сообществ Шу-Илийских гор в зависимости от степени нарушенности. Проведен анализ численности и возрастного состава популяций редких и эндемичных видов разных жизненных форм. Показано, что численность и возрастной спектр популяций зависит от площади, занимаемой видом, типа антропогенных факторов и погодных условий года. Наиболее благоприятная для возобновления возрастная структура отмечена у луковичных эфемероидов, стержнекорневых видов. Возобновляемость видов напрямую зависит от численности генеративных особей в популяциях и семенной продуктивности растений, что в свою очередь зависит от условий обитания популяций и воздействия на них внешних факторов.