Выделены периоды децентрализации высшего образования за рубежом для разных моделей автономии вузов. Предложена периодизация децентрализации высшего образования Казахстана. Установлены особенности таких трендов развития вузов в эпоху глобализации как: автономия вузов, академическая свобода и социальная отвественность вузов. Проведена обобщающая систематизация теории и практики по устойчивому развитию вузов в автономии. Дано определение траектории устойчивого развития вуза в условиях автономии. Определены ключевые критерии для построения структуры модели устойчивого развития вуза в условиях его разгосударствления. Обозначены основные компоненты концептуальной модели устойчивого развития вуза в условиях приобретения им автономности и разработано содержание данной модели. Построена и апробирована математическая модель прогноза сценариев учтойчивого развития вуза при внедрении системы автономии в организациях высшего образования.