Исследована минерализация воды водоемов бассейна р. Арысь и Кольсайских озер. Фитопланктон представлен 5-12 видами. Разнообразие зоопланктона составляет 2-22 вида. Разнообразие гидроценозов варьирует от 14 до 64 таксонов. Выведены закономерности изменения структуры гидроценозов в градиенте факторов среды. Выделены индикаторные показатели. Показано, что уровень органического загрязнения возрастает в ряду оз. Сары-Булак - Средний Кольсай - Верхний Кольсай - Нижний Кольсай. Процессы эвтрофированиея оз. Нижний, Средний и Верхний Кольсай в последние десятилетия усилились, биогенная нагрузка на оз. Сары-Булак снизилась. Установлено влияние малых концентраций тяжелых металлов на водорослевые сообщества и размерную структуру зоопланктона. Водоросли являются индикаторами краткосрочных воздействий, зоопланктон в большей степени отражает влияние долговременных факторов. Причинами ухудшения экологического состояния Кольсайских озер являются климатически обусловленное снижение уровня, повышение рекреационной нагрузки, вторичное обогащение биогенными элементами за счет гибели рыбы в скопившихся рыболовных сетях на дне оз. Нижний Кольсай.