Молекулярное типирование штаммов Y. pestis из трансграничного Сары-Джазского и Приаральского природных очагов чумы с использованием метода MLVA и сиквенс анализа
Full Name of the work head: Атшабар Б.Б.
Исполнители проекта: Курманов Б.К.
: Казахский научный центр карантинных и зоонозных инфекций им. М.Айкимбаева
Inventory number: 0216РК01042
Registration number: 0115РК00335
Keywords: Чума*Сары-Джазский очаг чумы*Приаральские очаги*Анализ Сиквенса
Проведен анализ изолятов Y. pestis с праймерами для дифференциации подвидов. Все изоляты относятся к основному подвиду чумного микроба. Проведено типирование изолятов Y. pestis с построением филогенетического древа. Основная часть штаммов из Сары-Джазского очага отличается по структуре локусов от штаммов из приаральских очагов и относится к биовару Antiqua. Изоляты из Приаралья филогенетически близки к референтному штамму KIM10 и относятся к биовару Mediaevalis. Выявлены эволюционные взаимосвязи в пределах вида Yersinia pestis.
