Сравнительная оценка биоразнообразия бактериофагов водного бассейна Или-Балхашского региона как инструмент изучения равновесного состояния экосистем
Full Name of the work head: Саданов А.К.
Исполнители проекта: Алексюк П.Г.
: Институт микробиологии и вирусологии
Inventory number: 0216РК01997
Registration number: 0115РК01095
Keywords: Бактериофаги*биоиндикация*экосистема
Разработаны тест-системы для количественного определения колифагов с использованием праймеров на ген главного капсидного белка, ген ДНК-полимеразы, ген 9 шипового отростка и ген нитевидного отростка вирусов семейства Myoviridae. Показано, что все разработанные тест-системы по определению колифагов методом ПЦР обладают высокой чувствительностью, специфичностью и хорошей стабильностью. Построена калибровочная кривая, позволяющая с помощью разработанных тест-систем провести количественную оценку колифагов в водных образцах в интервале от 10000 до 100000 вирусных частиц в мл. Подобраны праймеры, позволяющие получить ампликоны гена второй системы фотосинтеза фагов сине-зеленых водорослей, гена регулона фосфора семейства Myoviridae, гена ДНК хеликазы семейства Podoviridae и белка терминазы семейства Siphoviridae. Выделены препараты ДНК для получения ампликонов. Установлено, что наиболее эффективным является метод с применением магнитных бус Dynabeads MyOne Silane, позволяющий выделить до 82 % очищенной нуклеиновой кислоты относительно исходного объҒма. Обнаружено выраженное разнообразие вирусов семейств Phycodnaviridae, Mimiviridae и Inoviridae.