Проведен лабораторный скрининг образцов риса отечественной и зарубежной селекции из 29 генотипов на холодостойкость и холодочувствительность. Проведен физиолого-биохимический анализ на содержание свободного пролина и фосфора. Пониженная положительная температура на начальных этапах онтогенеза у большинства генотипов способствовала повышению содержания свободного пролина и общего фосфора как защитная реакция на действие пониженной температуры. Результаты показали, что пониженная температура перед цветением приводит к снижению урожайности, что является результатом нарушения температурного режима для нормального оплодотворения и в конечном счете, это привело к повышению пустозерности. В результате гибридизации холодостойких зарубежных сортов риса с сортами казахстанской селекции всего опылено 1771 завязей из 30 комбинации и получено 264 фертильных гибридных зерновок. Проведена идентификация количественных локусов холодостойкости в образцах риса зарубежной и отечественной селекции с маркерами: RM 24545; RM 1377; RM 231; RM 569 методом ПЦР-анализа.