Сравнительная оценка биоразнообразия бактериофагов водного бассейна Или-Балхашского региона как инструмент изучения равновесного состояния экосистем
Full Name of the work head: Саданов А.К.
Исполнители проекта: Алексюк П.Г.
: Институт микробиологии и вирусологии
Inventory number: 0215РК00693
Registration number: 0115РК01095
Keywords: Бактериофаги*Иле-Балхашский регион*Гены*Биоиндикация
Проведена оценка биоразнообразия цианофагов водного бассейна Иле-Балхашского региона в зависимости от степени загрязненности водоемов. Разработан способ биоиндикации состояния экосистемы Иле-Балхашского региона и степени ее загрязненности на основе количественного учета бактериофагов в водной среде. Установлено что, для проб с содержанием 105 инфекционных доз вируса эффективными методами концентрации вируссодержащего материала являются методы осаждения этанолом, высаливания и ультрацентрифугирования, для проб с содержанием 1 инфекционной дозы наиболее целесообразными являются методы ультрацентрифугирования и концентрации ПЭГ. Показано, что эволюционные изменения бактериофагов разных экосистем можно изучать путем сравнения отдельных генов-маркеров. Для этого отобраны ген большого структурного белка, ген ДНК-полимеразы, ген с 2 белка и ген супрессора литической инфекции, проведен дизайн праймеров для получения фрагментов этих генов, выбрано 4 пары праймеров, позволяющих достаточно эффективно получать ампликоны исследуемых генов. В результате проведенных экспедиций были собраны вируссодержащие образцы из различных водоемов Иле-Балхашского региона и из этих образцов выделены препараты ДНК, для дальнейшего количественного и качественного изучения бактериофагов. На модели коммерческих препаратов бактериофагов отработаны оптимальные условия получения ампликонов исследуемых генов бактериофагов и разработана тест-система для определения колифагов.