Оценка генетической изменчивости и фенотипических особенностей сои для повышения адаптации и продуктивности в различных агроклиматических условиях Казахстана
Руководитель проекта: Жамбакин К.Ж.
Исполнители проекта: Абугалиева С.И., Туруспеков Е.К.
Организация: Институт биологии и биотехнологии растений
Инвентарный номер: 0215РК01542
Регистрационный номер: 0115РК00216
Ключевые слова: Соя*Генотипирование*Фенотипирование*Генетическая карта
Изучены сортообразцы мировой коллекции сои четырех различных групп спелости в объеме 120 номеров ведущих стран производителей сои - США, Канада, Китай, Украина, Россия, Белорусь, Польша, Узбекистан, Франция, Чехия, Чехословакия, Швеция, Япония, Казахстан. Коллекция изучена по фенотипическим признакам роста в трех различных регионах Казахстана (Костанайская, Восточно-Казахстанская, Алматинская области). Образцы коллекции генотипированы с использованием SSR и SNP маркеров, и специфическими генами цветения. При генотипировании коллекции с применением 25 маркеров, связанных с фотопериодом, цветением и созреванием обнаружено 98 аллелей, со средним эффективным количеством аллелей, равным 2,9. Расcчитаны индексы генетического разнообразия Шеннона, Нея и PIC, равные 1,046; 0,557 и 0,509, соответственно. При генотипировании отобранных 92 образцов коллекции с применением SNP-маркеров использовалась технология секвенирования нового поколения и чипы компании Illumina на 6 тысяч SNP-маркеров. Всего генерировано 5233 маркеров, равномерно расположенных на 20 хромосомах генома сои. Для дальнейшего анализа, в результате фильтрации на полиморфные маркеры с низкочастотными аллелями, было отобрано 3206 SNP-маркеров (160.3 маркера/на хромосому). При работе со специфическими генами сои были использованы гены Е2 и Е3, связанные с регуляцией времени цветения. Анализ результатов позволил выявить, что 2/3 образцов являются чувствительными к длине фотопериода (ген Е3), 106 образцов из 120 характеризуются аллелем (ген Е2), определяющим скороспелость сои.