Молекулярное типирование штаммов Y. pestis из трансграничного Сары-Джазского и приаральских природных очагов чумы с использованием метода MLVA и сиквенс анализа
Full Name of the work head: Атшабар Б.Б.
Исполнители проекта: Курманов Б.К.
: Казахский научный центр карантинных и зоонозных инфекций им. М.Айкимбаева
Inventory number: 0215РК01213
Registration number: 0115РК00335
Keywords: молекулярное типирование*чума*Сары-Джазский очаг чумы*приаральские очаги чумы
Проведен анализ 27 штаммов Y.pestis с праймерами для дифференциации основных и неосновных подвидов. Разработан алгоритм проведения молекулярного типирования Y.pestis методом мультилокусного VNTR анализа. Штаммы Y.pestis типированы методом MLVA-7 с построением филогенетического древа: все штаммы основного подвида. Большинство штаммов из Сары-Джазского очага значительно отличаются по структуре изученных VNTR локусов от штаммов из приаральских очагов, родственны референтным штаммам CO92 (биовар orientalis) и Nepal516 (antiqua). Штаммы из Приаралья, один штамм из Сары-Джазского очага филогенетически близки к референтному штамму KIM10 (medievalis). Сары-Джазские штаммы Y.pestis обладают уникальной структурой VNTR локусов.
