Построены и исследованы модели эволюционирующих крупномасштабных структур Вселенной на фоне неоднородной вязкой жидкости для изотропной и анизотропной Вселенной. Исследованы различные переходы моделей крупномасштабных структур Вселенной, заполненной некой неоднородной вязкой жидкостью, в газовые состояния типа газа Чаплыгина и политропного газа. Построены численные и аналитические методы для моделирования моделей крупномасштабных структур Вселенной. Определен новый подход к решению динамических задач эволюции крупномасштабной структуры Вселенной на основе анализа описания природы темной энергии в виде реальной неоднородной вязкой жидкости.