Исследованы выделенные культуры цианобактерий из различных водных экосистем: горячий источник в п. Тургень, озера Иссык, Балхаш, Кольсай, реки Кеген, Каркара и Чарын. В пробах воды из экстремальных источников обитания (холодного озера Иссык, горячего источника п. Тургень, из залива Курты с повышенной концентрации солей восточной части озера Балхаш, обнаружено 19 представителей цианобактерий. Из них выделено 5 альгологически и бактериологически чистых штаммов. На основании морфологических характеристик и анализа нуклеотидных последовательностей генов 16S рРНК эти штаммы идентифицированы. Из проб воды рек Кеген, Каркара, Чарын и озера Кольсай, Райымбекского района выделено 15 культур цианобактерий, из них получены 2 аксеничных штамма. Установлены оптимальные условия культивирования для выделенных штаммов цианобактерий. Установлено, что оптимальной концентрацией NaCl в среде Заррука для штамма Cyanobacterium stanieri B-1 является вариант 2, где, концентрация NaCl - 2 г/л. Обнаружено, что липиды культур Cyanobacterium aponinum T-1 и Cyanobacterium stanieri B-1, богаты жирными кислотами с длиной цепи С14 (40%) и С16 (55% и 60% соответственно) относительно других исследованных видов. Тогда как штамм Cyanobacterium sp. Is-6 содержит жирные кислоты с длиной цепи С16 до 90%. Показано, что штамм Cyanobacterium stanieri B-1 в ходе скрининга по продуктивности биомассы характеризовался высокими показателями скорости роста и выхода биомассы.