Цель: изучение особенностей формирования феногенетической структуры животных в зависимости от селекционируемых признаков. Установлено, что генетическая структура популяции новой казахской полутонкорунной породы овец с кроссбредной шерстью обусловлена семью генеалогическими линиями, каждая из которых отличается определенной долей кровности участвующих в скрещивании пяти пород. Степень проявления селекционируемых признаков в фенотипе достаточно высока и отличается от стандарта породы на 8-27%. Ведущий признак одной линии имеет тенденцию к большей степени взаимосвязи с другими признаками, нежели в линиях другой специализации. Выявленные особенности формирования феногенетической структуры породы являются базой для дальнейшей разработки морфо-феногенетических основ повышения адаптивно-продуктивных качеств животных.