Y-хромосоманың геномдық деректерін талдау негізінде Орталық Азиядағы патрилиниялық экспансиясын зерттеу
Full Name of the work head: Акильжанова Айнур Рахметуловна
Исполнители проекта:
: National Laboratory Astana
Inventory number: 0218РК00653
Registration number: 0118РК01031
Keywords:
"Целью исследования послужило изучить экспансию предковых линий Y-хромосомы в Центральной Азии на основе анализа геномных данных. Результаты: Проведен рекрутинг участников исследования и сбор материалов. Собран 81 образец венозной крови, информированных согласий и анкет участников у представителей дунган, казахов, каракалпаков, киргизов, месхетинских турков, таджиков, узбеков, уйгуров в Алматинской, Жамбылской, Туркестанской областях и в городе Астана. Сформирована база данных по анкетам (N=241). Выделены ДНК из 81 образцов венозной крови, охарактеризованы их количество и качество. Средняя концентрация по nanoDrop - 668 нг/мкл, чистота 260/280 - 1.86 и 260/230 - 2.22, по Qubit 2.0 - 471 нг/мкл. Подготовлены аликвоты изучаемых образцов. Проведен фрагментный анализ 27-STR маркеров Y-хромосомы 300 мужчин казахов. Профили доступны в международной базе YHRD (Y Chromosome Haplotype Reference Database) под номерами YA004316 и YA004322. Было обнаружено 270 уникальных гаплотипов. Дискриминация по 27-STR маркерам для изученной выборки достигает 90%. Гаплотипы демонстрируют высокое внутрипопуляционное разнообразие. Анализ попарных генетических расстояний (RST) показал наименьшие значения между казахами и уйгурами, и казахами и монголами. Создана собственная база данных «Kazakhstan Y-chromosome haplotype reference database» включающая все литературные источники и генеалогические проекты, в которых представлены или упомянуты STR гаплотипы Y-хромосомы казахов (N=3650). Подготовлен отчет по проекту. За отчетный период опубликована одна статья в международном рецензируемом научном журнале с импакт фактором (International Journal of Legal Medicine, IF-2.382), принята одна статья в рецензируемом научном журнале, индексируемой в базе данных Scopus, и 2 тезиса в сборниках научных трудов по итогам международных конференций
"