Жаңа бактерияға қарсы препараттар құруда Қазақстанның қоршаған орта экологиялық нысандарынан оқшауланған бактериофагтарды пайдалану мүмкіндігін зерттеу
Руководитель проекта: Алексюк Павел Геннадьевич
Исполнители проекта:
Организация: Институт микробиологии и вирусологии
Инвентарный номер: 0218РК00326
Регистрационный номер: 0118РК00167
Ключевые слова:
"Объекты исследования: образцы почвы, образцы воды, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, бактериофаги лизирующие Escherichia coli и Pseudomonas aeruginosa.
В работе использовали приборное и методическое обеспечение, предназначенное для микробиологических, вирусологических и молекулярно-биологических исследований.
Целью проекта - изучение литических свойств бактериофагов, выделенных из объектов окружающей среды Казахстана, и выявление возможности создания новых антибактериальных средств на основе литических фагов для снижения уровня нозокомиальных инфекций.
Целью исследований на 2018 год - выделение из образцов окружающей среды бактериофагов, обладающих литическими свойствами и создание на их основе библиотеки.
В результате проведённых исследований за 2018 год установлено, что выявленные бактериофаги кишечной и синегнойной палочки в основном относятся к трем семействам порядка Caudovirales: Myoviridae, Podoviridae и Siphoviridae. При помощи метагеномного анализа показано, что наиболее широким разнообразием бактериофагов E. coli и Ps. aeruginosa обладают объекты окружающей среды с неблагополучной санитарной обстановкой. Отобрано 5 образцов почвы и 5 образцов воды предположительно содержащих бактериофаги семейств Myoviridae, Podoviridae и Syphoviridae, из которых было выделено 6 штаммов бактериофагов, лизирующих кишечную палочку и 6 штаммов бактериофагов лизирующих синегнойную палочку. Установлено, что все выделенные бактериофаги обладают высоким титром вирусных частиц, значительным уровнем литической активности, от 10-6 до 10-9, и видоспецифичностью по отношению к хозяину, что дает основание предполагать возможность использования данных штаммов бактериофагов для разработки новых антимикробных препаратов, предназначенных для борьбы с нозокомиальными инфекциями. Создано 12 библиотек геномов бактериофагов, средний размер фрагмента которых составлял 700-900 нуклеотидов, что полностью соответствует требованиям для проведения качественного множественного параллельного секвенирования на приборе MiSeq."