Қазақстан аумағында таралған дәріге төзімді Mycobacterium tuberculosis штаммдарын протеогеномдық талдау
Руководитель проекта: Тарлыков Павел Викторович
Исполнители проекта: Тарлыков П.В., Атавлиева С.Ш., Актаева С.А.
Организация: Национальный центр биотехнологии Республики Казахстан
Инвентарный номер: 0218РК00237
Регистрационный номер: 0118РК00928
Ключевые слова: "MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS, СЕКВЕНИРОВАНИЕ, МУТАЦИЯ,
СПОЛИГОТИПИРОВАНИЕ, МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ
"
"Объектом исследования являются клинические изоляты M.tuberculosis с различным спектром лекарственной чувствительности, а также музейный штамм H37Rv.
Цель работы - проведение комплексного анализа лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Казахстан.
В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, ПЦР, ПЦР в режиме реального времени, секвенирование.
В результате исследований была проведена подготовка геномных библиотек, а также проведено полногеномное секвенирование отобранных изолятов M. tuberculosis с различным спектром лекарственной чувствительности на основе подготовленных геномных библиотек. Определен профиль резистентности отобранных изолятов M. tuberculosis, обуславливающий устойчивость к препаратам первого и второго ряда. Спектр клинически значимых мутаций M. tuberculosis, ассоциированных с устойчивостью к противотуберкулезным препаратам первого ряда был представлен генами katG, rроВ, embB, pncA, rpsL и промоторной области гена fabG1. Спектр мутаций M. tuberculosis, ассоциированных с устойчивостью к противотуберкулезным препаратам второго ряда, был представлен генами gyrA, eis и rrs.
Новизна полученных результатов заключается в применении современного подхода молекулярного типирования штаммов M.tuberculosis, основанного на использовании технологии полногеномного полупроводникового секвенирования.
Степень внедрения. Так как проект имеет фундаментальный характер, степень внедрения результатов на данном этапе является низкой.
Экономическая эффективность - в результате определения вида лекарственной устойчивости изолятов микобактерии исключается возможность неправильного назначения дорогостоящих лекарственных средств.
Область применения - фтизиатрия
"