Создание базы данных коллекции микроорганизмов, клеточных культур, геномных и генно-инженерных материалов
Руководитель проекта: Календарь Руслан Николаевич
Исполнители проекта: Календарь Р.Н., Галимова М.Е., Данияров А.Ж.
Организация: Национальный центр биотехнологии Республики Казахстан
Инвентарный номер: 0218РК00233
Регистрационный номер: 0118РК00952
Ключевые слова: "БАЗА ДАННЫХ, ИНФОРМАЦИОННАЯ СИСТЕМА, БИОБАНК,
БИОПОЛИМЕР, ПОИСК
"
"Объектом исследований являются информационные базы данных для сбора и хранения данных по биообъектам.
Работа представляет собой обзор существующих подходов к вопросу выбора Системы Управления Базами Данных при построении информационных систем.
Вводится понятие Информационной Системы, рассматриваются вопросы специфики и организации таких систем, а также классификация архитектур информационных приложений. Дается обзор файл-серверных, клиент-серверных, Intranet-приложений и складов данных.
Вводится понятие СУБД, обсуждается необходимость ее использования в Информационных Системах. Освещаются вопросы типовой организации СУБД и основных подходов к построению моделей БД. Рассматриваются критерии, а также методология сравнения различных систем с целью выбора оптимального программного продукта в заданных условиях требований, к нему предъявляемых.
Основной целью работы является построение биоинформационных систем (БИС), обеспечивающей ввод, хранение, доступ, а также интеграцию с другими БИС данных, связанных с коллекциями, биобанками и генетическими конструкциями. С этой целью произведено исследование существующих методов и инструментов разработки и основные положения для реализации системы.
На основе результатов исследования разработан программный модуль, в виде группы приложений, внедренный в облачное хранилище казахстанских биологических данных.
Научная новизна исследований заключается в том, что результаты и разработки казахстанской научной деятельности будут размещены в ресурсе, обладающем собственной инфраструктурой, с использованием тенденций современных биотехнологий и информационных систем.
В работе использованы различные языки программирования, веб-фреймворки.
В качестве основного оборудования использовали локальные компьютеры Лаборатории геномики растений и биоинформатики.
Проведен анализ существующих БД, учтены их особенности при построении структурных блоков и объектов. Созданы физическая и логическая модели БД основных блоков данных для начального наполнения данными и тестирования. Подобран инструментарий, обладающий рядом преимуществ, по сравнению с аналогами.
Степень внедрения - доступ к объектам БД обеспечивается облачной платформой, размещенной на доменном имени genbank.kz.
Прогнозные предложения о развитии объектов исследований - развитие биоинформатической составляющей и других инновационных решений в представленной информационной системе.
Область применения - управление биологическими данными в научной деятельности. "