Гетерозис және стреске төзімділікпен байланысты дақылдардың геномында мобильді элементтердің белсенділігін зерттеу
Руководитель проекта: Календарь Руслан Николаевич
Исполнители проекта: Календарь Р.Н., Аменов А.А., Данияров А.Ж.
Организация: Национальный центр биотехнологии Республики Казахстан
Инвентарный номер: 0218РК00231
Регистрационный номер: 0118РК00934
Ключевые слова: "МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ, БИОИНФОРМАТИКА, МОБИЛЬНЫЙ
ЭЛЕМЕНТ, СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТЬ, КОРОТКИЙ
ПОВТОРЯЮЩИЙСЯ ЭЛЕМЕНТ
"
"Объекты исследования являлись линий Triticum aestivum (гибридов, скрещенных культурной формой пшеницы и пырея), кукурузы Zea mays, Zea diploperennis (диких и культурных форм), Sorghum bicolor
Цель работы - Сформировать коллекцию генетического материала злаковых культур, полученных при отдаленной межвидовой гибридизации.
Методы исследования: молекулярной и клеточной биологии, а также биоинформатики: программирование на Java, биоинформатический анализ ретротраснпозонов, сравнительный анализ последовательностей ДНК, множественное выравнивание последовательностей ДНК, подбор ПЦР праймеров т проб, выделения ДНК, ПЦР скрининг.
В качестве основного оборудования использовали спектрофотометр, бидистиллятор, ламинары, холодильники, термостаты, оборудование для ПЦР, центрифуги, сушильные шкафы, микроскопы, весы, автоклав, магнитные мешалки, рН-метр, камеры для электрофореза, гельдокументирующая система, компьютер.
В результате исследования был проведен поиск по мировым генетическим коллекциям семенного материала злаковых культур, полученной при отдаленной межвидовой гибридизации. Сформирована коллекция генетического материала злаковых культур, полученных при межвидовой гибридизации. Проведен полный анализ ретротранспозонов геномов злаковых культур. Сформирована ДНК- и РНК-коллекция злаковых культур, полученных при межвидовой гибридизации.
Последовательности рибосомальных генов рРНК для некоторых растительных видов были размещены в Генбанке NCBI под номерами: MH628291-MH628298, MH744122.
Были подготовлены две публикации в рецензируемые журналы и цитируемые в базе данных Scopus:
1.Kalendar R., Amenov A., Daniyarov A. Use of retrotransposon-derived genetic markers to analyze genomic variability in plants // Functional Plant Biology. - 2018. - Vol.45. - P. 1-10. DOI: 10.1071/FP18098 (Scopus CiteScore2017 = 2.45)
2.Vuorinen A., Kalendar R., Fahima T., Korpelainen H., Nevo E., Schulman A. Retrotransposon-Based Genetic Diversity Assessment in Wild Emmer Wheat (Triticum turgidum ssp. dicoccoides). Agronomy, 2018, Vol.8. - P. 107. DOI:10.3390/agronomy8070107 (Scopus CiteScore2017 = 2.38)
Результаты были представлены работы в рамках симпозиума «Астана Биотех 2018» г. Астана, 12-13 июня 2018 года:
1.Kalendar R., Amenov A, Daniyarov A. “The mobilization of retrotransposable elements to enhance genetic and epigenetic variability in plant” // Матер. междунар. симп. «Астана Биотех 2018». - Астана: НЦБ, 2018. - С. 194.
2.Аменов А.А., Данияров А.Ж., Календарь Р.Н. “Экстремальная цепная реакция для детекции ГМО” // Матер. междунар. симп. «Астана Биотех 2018». - Астана: НЦБ, 2018. - С. 104.
3.Аменов А.А., Данияров А.Ж., Календарь Р.Н. “Разработка мультиплексной ПЦР для выявления генно-модифицированных растений” // Матер. междунар. симп. «Астана Биотех 2018». - Астана: НЦБ, 2018. - С. 103.
Область применения: биотехнология."
