Разработка ПЦР тест-систем для идентификации молочнокислых бактерий и мониторинга качества различных продуктов питания
Full Name of the work head: Алмагамбетов К.Х.
Исполнители проекта: Шайхин С.М.*
: Республиканская коллекция микроорганизмов
Inventory number: 0214РК02116
Registration number: 0112РК00456
Keywords: молочнокислые бактерии*ПЦР*идентификация*генотипирование*продукты питания*секвенирование*
Из различных продуктов питания выделены 41 штамм молочнокислых бактерий. Штаммы охарактеризованы морфо-физиологически и биохимически. Идентификация проведена путем 16s-генотипирования. Изучены фенотипические особенности изолятов бактерий для отбора наиболее активных культур. Получены культуральные экстракты МКБ и изучены их антимикробные активности в условиях in vitro. Отработаны методы выделения ДНК из продуктов питания. Разработаны видоспецифичные ПЦР для определения систематического положения кисломолочных бактерий с электрофоретической и флуоресцентной детекцией. Проведена оценка чувствительности мультиплексной видоспецифичной ПЦР на модельной системе. Для видовой идентификации МКБ из ряда различных современных молекулярно-генетических методов использован метод RAPD-ПЦР. Получены RAPD-профили нескольких идентифицированных культур МКБ с использованием случайных праймеров. Получены SCAR-маркеры на основе видо- и штаммоспецифичных RAPD-профилей. Проверена возможность применения SCAR-PCR для идентификации микрофлоры, выделенной из различных источников.*
