Предсказание конформационной структуры протеинов методами распознавания образов и оптимизации
Full Name of the work head: Байгарин К.А.
Исполнители проекта: Маткаримов Б.Т.*
: Nazarbayev University Research and Innovation System
Inventory number: 0214РК02806
Registration number: 0112РК01092
Keywords: фолдинг протеина*предсказание конформационной структуры протеина*распознавание образов*оптимизация*динамическое программирование*разметка последовательности*марковские модели*
Исследованы эффективные технологии предсказания конформационной структуры протеина на основе его аминокислотной последовательности. Предложен подход к задаче разметки последовательности основанный на паттернах. Получены новые методы вывода и обучения на условных случайных полях основанных на паттернах. Предложены параметризация квазиэнергии CRF на паттернах, основанная на ядерных функциях и обобщение потенциала на паттернах для учета нелокальных парных взаимодействий переменных цепи. Получены первые экспериментальные результаты для альфа-протеинов, разработаны метрики сравнения методов обучения. Выполнен поиск оптимальных параметров силовой электроники и систем управления возобновляемой биоэнергетики с помощью генетических алгоритмов. Выполнен компьютерный анализ структурных данных комплексов репарационных белков с поврежденной дуплексной ДНК, аминокислотной последовательности и активности белка TDG.*
