Создание предпосылок персонализированного подхода в диагностике и лечении туберкулеза на основе полногеномного секвенирования M. tuberculosis
Full Name of the work head: Жумадилов Ж.Ш.
Исполнители проекта: Акильжанова А.Р.*
: Частное учреждение Центр наук о жизни
Inventory number: 0213РК01503
Registration number: 0113РК00598
Keywords: микобактерий*секвенирование полного генома*генетическая эпидемиология*гены микобактерий*туберкулез*
Проведен подбор пациентов туберкулезом в исследование, сбор клинических и эпидемиологических данных. Выделено 50 изолятов M.tuberculosis с различным спектром лекарственной чувствительности. Выделена ДНК микобактерий. Определены нуклеотидные последовательности генов rpoB, katG M.tuberculosis, обуславливающие лекарственную устойчивость к противотуберкулезным препаратам рифампицину, изониазиду. В гроВ гене обнаружено вариантов мутаций в 4 кодонах (531, 516, 526, 533). Среди изониазид-устойчивых клинических изолятов М. tuberculosis преобладала мутация в 315 кодоне гена katG Ser (серин)->Thr (треонин). Апробированы и внедрены методы секвенирования нового поколения на платформе GS FLX+ Roche. Проведено секвенирование полных геномов микобактерий 3 изолятов, проведена сборка полных геномов изолятов МТБ 476, МТБ 489, МТБ 505.*
