На основе проведенных экспериментов воздействия синтетических моющих средств на внутренние органы рыб (жабры, кишечник, печень, почки) Danio rerio и изучения гистоморфологического состояния внутренних органов рыб из естественных водоемов Иле-Балхашского бассейна были разработаны критерии оценки состояния внутренних органов, степень выраженности патологических реакций которых была оценена в баллах от 0 до 3, где 0 - отсутствие патологических реакций. На основе разработанной системы оценки внутренних органов было написано программное обеспечение Bio Fish ver 1.2 и сформирована база данных, которая позволяет количественно оценить состояние внутренних органов рыб биоиндикаторов в виде коэффициента повреждения и соответственно дать оценку состояния водных экосистем. Проведение биотестирования естественных водоемов, с помощью оценки состояния внутренних органов видов биоиндикаторов, показало, что наиболее высокий уровень загрязнения на тестированной территории Иле-Балхашского бассейна, наблюдается в дельте р. Иле, наиболее низкий уровень загрязнения - в прудовом хозяйстве. Средний уровень загрязнения, по результатам тестирования, наблюдается в оз. Балхаш. Полученные ранее результаты по гистопатологическим нарушениям в контроле и эксперименте нашли подтверждение в результате применения программы Bio Fish ver 1.2. Использование количественных характеристик нарушений внутренних органов - коэффициента повреждения внутренних органов - позволило сделать сравнительную оценку состояния здоровья рыб, и, как следствие, - оценку состояния окружающей среды, а применение программы Bio Fish ver 1.2 значительно упростило и унифицировало выполнение поставленной задачи. Разработанное программное обеспечение Bio Fish ver 1.2 может быть использовано для проведения мониторинговых исследований водоемов в экологии и в ихтиологических исследованиях.*