Проведено исследование математической модели кластерной трехсекторной экономики. Проведен анализ стратегии развития кластерных экономических систем и казахстанской кластерной инициативы для инновационного развития и повышения конкурентоспособности хозяйствующих субъектов. Разработаны алгоритмы и программы для оптимального распределения инвестиционных и трудовых ресурсов с целью обеспечения сбалансированного роста кластерной экономической системы. Предложен новый конструктивный метод управления кластерными экономическими системами с учетом заданного функционала. *