Исследована коллекция риса (Oryza sativa L.), состоящая из 96 сортов и линий отечественной и зарубежной селекции. Выявлен 191 полиморфный маркер (49,7 %). Составлен генетический паспорт для 96 сортов и линий риса. Индекс разнообразия по Нею (1978) для коммерческих сортов РК составил 0,138, что было ниже, чем для всех оставшихся 46 образцов (0,144 (+ -) 0,019). Полученные результаты позволили сконструировать сходные филогенетические деревья коллекции риса Казахстана при использовании SSR- и SNP маркеров и идентифицировать образцы с подвидами japonica, indica, и гибриды между ними. Выделен ряд линий по скороспелости, высоте растений, урожайности, массе 1000 зерен, продуктивности метелки, стекловидности эндосперма, выходу сортовой муки и др. Выявлено 10 статистически достоверных ассоциаций (Р<0,0001) между ДНК-маркерами и технологическими признаками риса - толщина зерновки, ширина зерновки и отношение длины к ширине зерновки. Выявлены стабильные перспективные линии риса с высокой продуктивностью в условиях выращивания в Кызылордниской области Казахстана. Полученные результаты могут быть эффективно использованы в селекции риса направленные на повышение качества зерна.*