Поиск арифметической структуры генома
Full Name of the work head: Евсеева А.У.
Исполнители проекта: Щербак В.И.*
: Научно-инженерный информационно-вычислительный центр
Inventory number: 0214РК00507
Registration number: 0112РК00146
Keywords: геномы*генетический код*биоинформатика*компьютерные коды*оцифровка оснований*арифметическая структура геномов*
Проведен анализ вклада транспозонов, палиндромов и повторов различного типа во второе правило Чаргаффа в разных геномах. Установлено, что это правило для олигонуклеотидов есть следствие его наличия у мононуклеотидов, а не наоборот. Проведена оценка отклонения этого правила в геномах органелл, ДНК- и РНК-вирусов. Новые данные указывают на более широкий охват геномов правилом. Проведен анализ связи правила с аминокислотным составом белков. Получены данные о сугубо информационном типе генетического отбора оснований при возникновении симметрии нитей ДНК по данному правилу. Выявлено, что аминокислотный состав белков нейтрален по отношению к проявлению второго правила. Проведено исследование генов и других частей геномов на наличие контрольных сумм в оцифровке в позиционных системах. Результат не зафиксировал статистически значимого предпочтения оцифровки по артефакту генетического кода, но указал возможную функциональную связь ее особого синтаксиса и сути феномена этого правила Чаргаффа. Ультраконсервативные последовательности и периодические паттерны генома человека изучены в аспекте гипотезы геномного SETI, проведен поиск последовательностей простых чисел. Анализ выявил в X и Y хромосомах человека статистически значимые патерны, часть которых идентична центральной строке идеограммы генетического кода. Их причастность к проявлению геномного SETI покажет дальнейший критический анализ.*