Создание предпосылок персонализированного подхода в диагностике и лечении туберкулеза на основе полногеномного секвенирования M. tuberculosis
Full Name of the work head: Исаева Р.Б.
Исполнители проекта: Акильжанова А.Р.*
: Частное учреждение Центр наук о жизни
Inventory number: 0214РК02228
Registration number: 0113РК00598
Keywords: микобактерии туберкулеза*полногеномное секвенирование*туберкулез*диагностика туберкулеза*
Собраны клинические изоляты M.tuberculosis с различным спектром лекарственной устойчивости для проведения генетического анализа (109 изолятов), у которых выделена ДНК. Произведен посев и тесты на лекарственную чувствительность M. tuberculosis к противотуберкулезным препаратам 1 и 2 ряда всех собранных образцов. Проведено изучение вирулентности 5 групп штаммов МБТ: мультирезистентных, XDR-ТБ, полирезистентных, монорезистентных и чувствительных, при этом высокая вирулентность наблюдалась как среди чувствительных, так и среди монорезистентных и полирезистентных штаммов M. tuberculosis. Структура DR-региона методом сполиготипирования была определена для 54 штаммов M. tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом в различных регионов Казахстана. Результаты генотипирования данной выборки казахстанских штаммов M.tuberculosis, методом сполиготипирования показал преобладание штаммов семейства Beijing. Подготовлены ДНК библиотеки 20 образцов M.tuberculosis с различным профилем лекарственной устойчивости, проводится подготовка образцов для эмульсионной ПЦР и секвенирования на платформе GS FLX + Roche. Результаты сборки двух геномов M. tuberculosis были загружены в базу данных NCBI GenBank и доступны для публичного доступа под номерами AZBA00000000, AZAZ00000000.*