Изучение эволюционной изменчивости орто- и парамиксовирусов диких птиц
Full Name of the work head: Саданов А.К.
Исполнители проекта: Жуматов К.Х.*Саятов М.Х.*
: Институт микробиологии и вирусологии
Inventory number: 0214РК01367
Registration number: 0112РК00196
Keywords: экология*дикая птица*вирус гриппа А*парамиксовирус*подтип*штаммы*изолят*гемагглютинин*ген*полимеразная цепная реакция*филогенез*
Исследованы биологические образцы от диких птиц водного и околоводного комплексов, а также штаммы вирусов гриппа А и парамиксовирусов серотипов 6 и 8, выделенные от птиц в Западном, Центральном, Северном и Южном Казахстане. Во время 23 экспедиционных выездов собрана 1341 биологическая проба от 866 особей относящихся к 42 видам диких птиц из 23 семейств 11 отрядов: Гусеобразные, Журавлеобразные, Поганкообразные, Аистообразные, Ржанкообразные, Воробьинообразные, Ракшеобразные, Пеликанообразные, Голубеобразные, Соколообразные, Совообразные. Использован комплекс вирусологических, иммунологических и молекулярно-генетических методов исследований. Выделено 42 гемагглютинирующих агента, девять их которых отнесены к вирусам гриппа А, и 18 - к семейству парамиксовирусов птиц. Впервые проведенный сравнительный молекулярно-биологический анализ генов неструктурного, поверхностного (гемагглютинин) и внутренних (нуклеопротеин, матрикс) белков казахстанских изолятов вирусов гриппа птиц подтипов Н5, Н13 и Н1 выявил выраженные различия их филогенеза по этим генам и принадлежность к различным эволюционным линиям. Результаты исследования свидетельствуют о вовлечении территории РК в процессы мировой циркуляции и эволюции возбудителей гриппа, и важной роли в этом мест совместного обитания диких птиц водного и околоводного комплексов, а также трансконтинентальных миграционных путей, через которые осуществляется перенос вирусов гриппа А различных филогенетических линий. Впервые в Центрально-Азиатском регионе от диких птиц выделены парамиксовирусы серотипов 6 и 8 и секвенированы их полные геномы. Филогенетический анализ генов F белков, показал, что штаммы ПМВ-6/красноносый нырок/Балхаш/5842/2013 и APMV-6/mallard/Jilin/127/2011 из Китая образуют отдельный филогенетический кластер. Казахстанский изолят ПМВ-8/белолобый гусь/СКО/5765/13 оказался отличным от других парамиксовирусов серотипа 8 и формирует отдельную ветвь. Установлены структурные особенности сайта расщепления F белков этих вирусов. Оригинальный штамм вируса гриппа А/красноносый нырок/Балхаш/4523/10 (Н1N2) депонирован в Национальной коллекции вирусов РК и рекомендуется в качестве диагностикума при проведении вирусологических и серологических исследований.*