Изучение экологии и генетического разнообразия парамиксовирусов диких и домашних птиц Казахстана
Full Name of the work head: Саданов А.К.
Исполнители проекта: Карамендин К.О.*
: Институт микробиологии и вирусологии
Inventory number: 0214РК01349
Registration number: 0112РК02470
Keywords: экология*парамиксовирус*дикая птица*штаммы*полимеразная цепная реакция*секвенирование*
Выполнена комплексная экологическая и молекулярно-генетическая оценка современного состояния популяций парамиксовирусов, циркулирующих среди диких и домашних птиц в Казахстане. При вирусологическом исследовании 695 биопроб от 450 особей диких птиц и 55 образцов от домашних птиц, собранных в различных регионах РК выделено 15 гемагглютинирующих агентов. В реакции торможения гемагглютинации и методом молекулярной диагностики все агенты идентифицированы как парамиксовирусы серотипа 1. В сайте расщепления F-белка в позициях 112-116 у парамиксовирусов, изолированных в птицеводческом хозяйстве выявлено наличие основных аминокислот RRGKR и КRGKR, что является одним из признаков их высокой патогенности. У вирусов от диких птиц указанные аминокислоты в этом сайте отсутствуют, что свидетельствует об их низкой патогенности для птиц. В результате секвенирования полного генома и последующего филогенетического анализа установлена принадлежность казахстанского штамма APMV-1/chicken/Almaty/41/2013 к высокопатогенному вирусу 7 генотипа, изоляты от диких птиц отнесены к классу 1, который состоит в основном из низко- или апатогенных штаммов парамиксовирусов серотипа1. Рекомендовано для использования ветеринарными службами при расшифровке вспышек заболеваемости и контроле возникающих чрезвычайных эпидемических ситуаций в РК.*