Мета-анализ транскриптомов онкологических заболеваний на основе высокоплотных ДНК-микрочипов
Руководитель проекта: Момыналиев К.Т.
Исполнители проекта: Каиров У.Е.*
Организация: Национальный центр биотехнологий
Инвентарный номер: 0213РК02241
Регистрационный номер: 0112РК00348
Ключевые слова: ДНК-микрочипы*ген*кластеризация*корреляционные графы*мета-анализ онкозаболевания*метод независимых компонент*
При проведении мета-анализа данных высокоплотных ДНК-микрочипов для изучения биологических процессов в различных онкозаболеваниях исследованы необработанные данные высокоплотных микрочипов с транскрипционными профилями с различных типов опухолевых тканей. В результате проведенных исследований были выполнены необходимые процедуры подготовки отобранных наборов данных по раку молочной железы (микрочиповые платформы HG-U1ЗЗА, HG-U133_plus2), раку легких, раку простаты и раку яичников к анализу методом независимых компонент. Предложена модель применимости метода независимых компонент для изучения раковых транскриптомов, полученных на основе применения высокоплотных микрочипов. Разработан подход мета-анализа транскриптомных данных с применением математического метода и последующей визуализацией в виде корреляционных графов. Проведены корреляционный анализ наборов данных и сравнительный анализ независимых компонент из наборов данных рака молочной железы, рака легких, рака простаты и рака яичников путем построения первичных корреляционных графов.*