Определены основные загрязнители в пробах воды, почвы и донных отложений Или-Балхашского бассейна. Приоритетными загрязнителями являются тяжелые металлы. Выявлена слабая токсичность проб воды оз. Балхаш в окрестностях г. Приозерск. Пробы обладают выраженным мутагенным эффектом. Умеренный мутагенный эффект показали пробы воды из Капчагайского водохранилища в месте впадения рек Каскелен и Б. Алматинка. Слабая степень мутагенности характерна для образцов воды в окрестностях п. Чунджа и г. Балхаш. У всех проб воды обнаружен слабый тератогенный эффект. Уровень мутагенности коррелирует с высоким содержанием кобальта, свинца и кадмия.