Проведен РСR-анализ родительских форм экспериментальной картирующей популяции - сорта Южно-Казахстанский 43 и линии дикорастущего ячменя Н. spontaneum К. с использованием 45 комбинаций AFLP и 57 пар SSR-праймеров. Построена генетическая карта ячменя ЮК43 х Н. sp. Выявлены локусы, детерминирующие показатели засухоустойчивости. Обнаружены ДНК-маркеры, сцепленные с QTL, ассоциированными с засухоустойчивостью. Отобраны 5 линий пивоваренного и 6 линий кормового направлений, отличающиеся засухоустойчивостью и продуктивностью в условиях полива и богары.