Изучен опыт создания инновационных (предпринимательских) университетов Европы и США. Разработаны принципы реинжиниринга технических вузов и изменения корпоративной культуры. Казахстанская модель системы управления инновационным университетом предусматривает переход от функционального подхода к процессному с использованием матричных структур и проектных методов управления. В системе использована рейтинговая оценка деятельности преподавателей и успеваемости студентов. Важным элементом системы управления является подсистема студенческого самоуправления.