Проведен мониторинг среды обитания гидробионтов, состояния гидробиоценозов и ихтиоценозов. Осуществлен морфологический анализ особей основных промысловых видов рыб Алакольской системы озер, Бухтарминского, Капшагайского, Шардаринского водохранилищ, Урало-Каспийского бассейна, оз. Балхаш. Оценены условия обитания рыб. Выделены фенетические маркеры, позволяющие выявить механизм возникновения различий в микропопуляционных характеристиках рыб из различных водоемов.