Объект исследования: сорта и линии твердой пшеницы (Triticum durum Desf.) и озимого гексаплоидного тритикале (X Triticcsecale Wittm.). Цель: разработка высокоэффективных методов молекулярно-генетической идентификации ценных генотипов зерновых культур. Проанализированы показатели качества зерна пшеницы и тритикале. По содержанию клейковины 3 линии и сорт Оренбургская 10 отнесены ко II группе качества, пригодной для производства макарон. По показателям стекловидности, качества и количества клейковины выявлены генотипы с наиболее оптимальными характеристиками. Проведен анализ аллелей энзимкодирующих локусов генотипов. У локусов Mdh-2 и Est-3 полиморфизм не выявлен. У линии Д-18053/1-2 обнаружено уникальное сочетание аллелей локусов бета-Amy и Adh-1. По индексам твердозерности 23 % образцов тритикале пригодны для производства хлеба, 16 % - для пивоварения, остальные (мягкозерные) рекомендовано использовать в производстве кондитерских изделий.