Известный учёный-генетик Сайтоу Наруйа прочитал лекции в НИИ генетики и физиологии
Академические обмены - важная составляющая научной жизни. Обмен опытом, знаниями, методологией, личные знакомства способствуют развитию различных научных направлений и школ.
Одной из форм таких обменов является приглашение ведущих учёных с мировым именем, которые читают лекции, рассказывают о результатах и перспективах исследований, отвечают на вопросы.
По приглашению Института генетики и физиологии Казахстан посетил учёный-исследователь из Японии - профессор Сайтоу Наруйа, директор Asia Genome Tao Center (AGTC) при Национальном Институте Генетики (Япония).
Исследования профессора Сайтоу Наруйа в основном сосредоточены на изучении эволюции организмов на геномном уровне посредством компьютерного анализа и секвенирования генома. Учёным опубликовано более50-ти научных работ в международных журналах, таких как: Nature, Science, Anthropo logical Science, Journa lof Human Genetics, Genome Biology and Evolution,Springer Evolutionary Study Series, iDarwin, Molecular Biology and Evolution, Journal of Arid Land Studies, BMC Bioinformatics ,DNA Research, Molecular Phylogenetics and Evolution. Индекс Хирша по Scopus - 47.
Одним из выдающихся достижений профессора Сайтоу Наруйя является создание биоинформатического метода кластеризации для создания филогенетических деревьев - «Neighborjoining», совместно с профессором Университета штата Пенсильвания и директором Института молекулярной эволюционной генетики Матасоши Ней. Эта работа на текущий момент (согласно данным Google Scholar) имеет 66895 цитирований . В 2014 году один из самых авторитетных и ведущих научных журналов Nature представил список ТОП 100 самых цитируемых исследований, в котором работа Сайтоу и Ней заняла 20-ое место.
Первая лекция «Estimation of humanpopulation history» посвящена полногеномному исследованию различных народностей Юго-Восточной Азии, а так же уйгуров, китайцев, денисовцев и якутов. Профессор Сайтоу Наруйа и его коллегами были проведены сравнительные анализы континентальных и неконтинентальных народов, в частности, работы были направлены на филогенетическое и антропологическое изучение популяций, особое внимание уделялось миграционному и эволюционному процессу.
Учитывая тот факт, что профессор Сайтоу родом из Японии, большая часть его научных интересов заключалась в изучении народностей, населяющих географическую территорию Японезии. Если в Казахстане популяции казахов подразделены на жузы, а затем на многочисленные роды, то в Японии народы состоят из трёх народностей, географически поделённых на Северные (народ Айну) , Центральные (народ Ямато, к которому относится сам профессор) и Южные (народ Окинава) группы. Появление этих народностей объяснено тремя различными миграционными волнами, произошедшими в определённые временные периоды. Распространение последних двух тесно связано с агрокультурной революцией, в то время как первые являлись охотниками-собирателями (рыболовами). Айну имеют самое большое родство с народом Дзёмон, которые так же являлись охотниками-собирателями. Еще одним из любопытных выводов исследований были данные, основанные на изучении лингвистических групп и их взаимосвязи с миграционными процессами. В заключение профессор Сайтоу рассказал о новом научном журнале “iDarwin”, в котором он является одним из основных редакторов.
Профессор был приятно удивлен, узнав об исследованиях нашего института в области генетики древних и современных казахов. Работа наших ученых вызвала его живой интерес к нашей методики и банку генетического материала.
Следующая тема, которая легла за основу второй лекции профессора Сайтоу “Phylogenetic reconstruction”. Построение филогенетических деревьев из данных о последовательностях нуклеотидов или аминокислот, является одной из магистральных областей эволюционной геномики. Профессор поделился своими, а так же актуальными работами своих бывших и нынешних учеников, касающихся данной области. Обсуждая методики построения филогенетических деревьев, профессор рассказал о своем новом методе матрицы расстояний для быстрого построения больших филогенетических деревьев. Этот новый метод называется “External Edge Elimination” (Устранение внешних границ) или методом 3E в качестве его аббревиатуры. Из достоинств данного метода стоит отметить его быстроту в сравнении с другими традиционными инструментами построения филогенетических деревьев.
Третья и заключительная лекция профессора Сайтоу была на тему: «Analyses of CNS Evolution» (Анализ эволюции консервативных некодирующих последовательностей ДНК). Гость института отметил важнейшие вехи и открытия в данном направлении исследований, а так же ознакомил слушателей с научно-исследовательскими работами своих студентов и лаборатории. Согласно мнению профессора, данные участки ДНК не кодируют белки, являются структурными и регуляторными элементами генома и самое удивительное то, что данные участки в ходе эволюции подверглись наименьшим мутационным изменениям и отчетливо хорошо сохранены не только у рядом стоящих родственных видов организмов, включая человека, но и идентичны у совершенно разных видов животных и растений. Поскольку природа сохраняет данные участки генома в широчайшем спектре различных видов, значит это не просто, в этом есть своя важная роль. Сам же профессор Сайтоу очень увлечен данной тематикой и связывает свои дальнейшие исследования с этой областью, упомянув, что это прекрасное направление для нашего института и что он открыт всем интересующимся студентам и желающим проводить исследования в этой области.
Материал подготовлен А. Бекитаевой, Д. Жабаевой, сотрудниками Института генетики и физиологии.