Учёные Казахского национального аграрного университета реализуют проект, цель которого - изучение вирусного разнообразия верхних дыхательных путей человека методом секвенирования нового поколения (NGS) при острых респираторных вирусных инфекциях, идентификация возбудителей, включая редкие, зоонозные, бессимптомные и ранее не встречающиеся вирусы, и оценка данных биоинформатики для практического применения в борьбе с инфекционными болезнями человека.

Вирусы являются наиболее распространёнными инфекционными агентами на Земле. По подсчетам ученых неизвестными до сих пор остаются более 1 миллион 600 тысяч вирусов из 25 вирусных семейств. Из них от 600-800 тысяч могут оказаться инфекционными для людей.

Особый интерес в этом плане представляют вирусы, вызывающие заболевания и в частности ОРВИ. ОРВИ разной этиологии, по данным ВОЗ, занимают одно из первых мест среди всех инфекционных заболеваний, на долю которых приходится 90-95% всех случаев инфекционных заболеваний во всем мире, что приводит к приблизительно 2 миллионам смертей в год.

Виромом или «вирусным метагеномом» называют вирусный компонент микробиома человека. С одной стороны – это вирусы, которые вызывают острую, постоянную или латентную инфекции, с другой стороны – интегрированные в геном человека, при этом у каждого индивидуума свой уникальный виром с неповторимым набором штаммов вирусов.

В современной науке всестороннее изучение всех классов микроорганизмов, в том числе и вирусов, присутствующих в различных биотопах человека, является перспективным направлением. Исследования верома человека может дать ответы на многие вопросы о сохранении здоровья, формировании и поддержке иммунитета у детей и ослабленных пациентов, выявить новые неизвестные вирусы.

Внедрение метода NGS (англ. next generation sequencing) в лабораторную практику по идентификации вирусных инфекций имеет огромный потенциал для получения фундаментальной информации по вирусному составу человека при различных состояниях, включая инфекционные заболевания и ОРВИ. Комбинация независимой от последовательности амплификации с NGS потенциально можно обнаружить вирусные и невирусные патогены в клиническом образце без активного нацеливания на конкретные мишени, а также получить дополнительную генетическую информацию о носителе – включая иммунный статус человека и его медицинские геномные данные. Данный метод успешно применялся для идентификации и геномной характеристики вирусов гриппа A (IAV) и вируса гепатита C. Фундаментальные данные, полученные в рамках проекта дадут реальную картину разнообразия респираторных вирусных инфекций у человека, будут основой для совершенствования противоэпидемиологических и профилактических мероприятий для служб здравоохранения.

В результате реализации проекта будут получены карты вирома верхних дыхательных путей человека при ОРВИ с описанием встречающихся вирусов, их свойствах, инфекционном потенциале и прочие. Будет представлена информация по разнообразию респираторных вирусов, которые присутствуют в верхних дыхательных путях человека. В процессе исследований будут выявлены широко распространенные респираторные вирусы, регулярно выявляемых у человека, а также вирусы, которые ранее не выявлялись у человека. Ожидается, что в научном аспекте результаты фундаментальных исследований данного проекта внесут существенный вклад в развитие многих прикладных исследований, направленных на борьбу с инфекционными респираторными инфекциями. Будет представлена реальная картина по присутствию респираторных вирусов у людей, которая может стать основой для успешной и целенаправленной борьбы с инфекционными болезнями.

В перспективе результаты проекта будут способствовать совершенствованию мер по защите здоровья населения Казахстана и развитию медицинской науки.

Проект по грантовому финансированию AP09259192 на 2021-2023 гг.
Тема проекта: Виром человека: изучение разнообразия вирусных респираторных инфекций методом NGS секвенирования.

Научный руководитель: Сандыбаев Нурлан Тамамбаевич, кандидат биологических наук, профессор

по материалам https://www.kaznaru.edu.kz