Proteomic analysis of Sulfolobus Solfataricus during Sulfolobus turreted Icosahedral Virus Infection
Автор(ы): Maaty W. S.*Selvig K.*Ryder S.*Tarlykov P.*Hilmer J. K.*Heinemann J.*Steffens J.*Snyder J. C.*Ortmann A. C.*Movahed N.*Spicka K.*Chetia L.*Grieco P. A.*Dratz E. A.*Douglas T.*Young M. J.*Bothner B.*
Реферат: Where there is life, there are viruses. The impact of viruses on evolution6 global nutrient cycling, and disease has driven research on their cellular and molecular biology. Knowledge exists for a wide range of viruses; however, a major exception are viruses with archaeal hosts. Archaeal virus-host systems are of great interest because they have similarities to both eukaryotic and bacterial systems and often live in extreme environments. Here we report the first proteomics-based experiments on archaeal host response to viral infection. Sulfolobus Turreted Icosahedral Virus (STIV) infection of Sulfolobus solfataricus P2 was studied using 1D and 2D differential gel electrophoresis (DIGE) to measure abundance and redox changes. Cysteine reactivity was measured using novel fluorescent zwitterionic chemical probes that, together with abundance changes, suggest that virus and host are both vying for control of redox status in the cells. Proteins from nearly 50% of the predicted viral open reading frames were found along with a new STIV protein with a homologue in STIV2. This study provides insight to features of viral replication novel to the archaea, makes strong connections to well-described mechanisms used by eukaryotic viruses such as ESCRT-III mediated transport, and emphasizes the complementary nature of different omics approaches.
Prevalence and subtypes of BK virus in pediatric renal transplant recipients in Russia
Автор(ы): Momynaliev K. T.*Gorbatenko E. V.*Shevtsov A. B.*Gribanov O. G.*Babenko N. N.*Kaabak M. M.*
Объем документа: С. 151-159
МРНТИ: 34.25.17
Ключевые слова: педиатрия*детские почечные трансплантаты*нарушения функций трансплантата*вирусы ВК*
Реферат: BKV reactivation is associated with impaired graft function in kidney transplant patients. The objective of our study was to determine the prevalence of BKV infection in consecutive pediatric kidney transplant recipients at our center. Fifty-eight pediatric kidney transplant recipients were studied. The mean age at screening was 9.4+-2.8 yr, and samples were obtained at a median of 2.4+-1.4 yr after transplantation. BKV-DNA was analyzed in urine and plasma by quantitative PCR. Occurrences of BK-DNAuria and BK-DNAemia did not change in the first two yr after transplantation in children and amounted to 21-23% and 7-8%, respectively (p>0.05). In the third year, the occurrences of BK-DNAuria and BK-DNAemia increased insignificantly to 27% and 9% in the pediatric patients. We also determined the subtypes and subgroups of BK virus isolated from Russian renal transplant recipients and found that BKV isolates were composed of subtypes Ib-2 and IV/c2. The data we obtained indicate that although only 5% of BKVAN cases occurred between years two and five post-transplantation, it seems necessary to regularly monitor pediatric patients for BKV infection through the third year after transplantation.
Network analysis of gene lists for finding reproducible prognostic breast cancer gene signatures
Ключевые слова: молекулярная биология*ранжированный список генов*рак молочной железы*метод классификации генов*
Реферат: Many genome-scale studies in molecular biology deliver results in the form of a ranked list of gene names, accordingly to some scoring method. There is always the question how many top-ranked genes to consider for further analysis, for example, in order creating a diagnostic or predictive gene signature for a disease. This question is usually approached from a statistical point of view, without considering any biological properties of top-ranked genes or how they are related to each other functionally. Here we suggest a new method for selecting a number of genes in a ranked gene list such that this set forms the Optimally Functionally Enriched Network (OFTEN), formed by known physical interactions between genes or their products. The method allows associating a network with the gene list, providing easier interpretation of the results and classifying the genes or proteins accordingly to their position in the resulting network. We demonstrate the method on four breast cancer datasets and show that 1) the resulting gene signatures are more reproducible from one dataset to another compared to standard statistical procedures and 2) the overlap of these signatures has significant prognostic potential. The method is implemented in BiNoM Cytoscape plugin.
Получение антигенов для диагностики трихофитии овец
Реферат: В статье раскрываются этапы работы по выделению, очистке и изучению специфической активности антигенов гриба Trichophyton autotrophycum - возбудителя трихофитии овец, для использования в качестве компонентов в непрямом ИФА.
Entrepreneurial development in Kazakhstan: A review and update
Автор(ы): Teal E. J.*Toxanova A. N.*Izzo G. M.*
Объем документа: С. 1-10
МРНТИ: 06.52.42
Ключевые слова: поддержка предпринимательства*малый бизнес*экономика Казахстана*рыночная экономика*
Реферат: Under the leadership of President Nursultan Nazarbayev the economy of Kazakhstan has been transformed from a command economy to an emerging and market-based economy. An important part of this transformation has been the establishment of laws and infrastructure to support the previously illegal activity of entrepreneurship and the operation of small businesses in Kazakhstan. This paper provides an overview of infrastructure development to support entrepreneurship within the new independent state.
Реферат: В статье освещаются проблемы аккультурации между древними тюрками и восточными славянами. Раскрываются эквиполентные мировоззренческие парадигмы исследуемых этносов, образовавшиеся в древнюю эпоху.
Мировая практика привлечения иностранных инвестиций в условиях финансового кризиса
Реферат: В статье формулируется цель опыта использования привлечения прямых иностранных инвестиции в Россию и республику Казахстан на основе мировой практики. Рассматриваются факторы и принципы, влияющие на приток иностранных инвестиций, приоритетные цели стран, использование при этом наибольшего набора инструментов. Одним из действенных инструментов государственной инвестиционной политики во всем мире служит создание и функционирование свободных экономических зон (далее - СЭЗ). Главной задачей СЭЗ являются быстрое включение страны в международное разделение труда, распределение инвестиционных потоков между регионами. Акцентируется внимание фактору транснационализации, как важному каналу финансирования иностранных инвестиций, однако в ряде стран существуют ограничения, что является одной из причин активного развития рынка ценных бумаг. Выявлены проблемы привлечения иностранных инвестиций, делается вывод о том, что опыт мировой практики может положительно сказаться в инвестиционной политике России и Казахстана.
Оценка потенциальных масштабов использования IPO в качестве источника привлечения капитала
Реферат: В статье формулируются преимущества IPO перед другими инвестиционными источниками. Приведен краткий обзор распространения IPO в мировой практике, указаны цели и его влияние на привлечение инвестиции. На основе анализа эффективности результатов IPO систематизированы преимущества IPO перед другими инвестиционными источниками, показаны критерии выбора источников привлечения инвестиции, по сравнению с альтернативными источниками привлечения капитала с положительными и отрицательными моментами для эмитента. Предложена модель возможности механизма IPO. Произведен анализ и поставлены проблемы внедрения IPO в Казахстане, предложены меры, которые могут способствовать активизации IPO казахстанских компании. Выявлены результативность перспектив IPO для стран с переходной экономикой: России, Казахстана, Индии, Китая, а также Бразилии и Турции.
Актуальные проблемы развития страхования в сельском хозяйстве Казахстана
Реферат: В статье рассмотрены актуальные проблемы страхования в сельском хозяйстве Казахстана. Основное внимание уделено роли государства в развития сельскохозяйственного страхования. Проведен анализ системы страхования сельского хозяйства в Республике Казахстан за 2005-2010 годы. Разработаны предложения дальнейшего совершенствования сельскохозяйственного страхования и перспективы развития обществ взаимного страхования.
Факторы устойчивого развития аграрного сектора Казахстана
Реферат: Научная статья содержит теоретические и практические аспекты сущности перехода к устойчивому развитию экономики Казахстана в свете принятой Концепции в 2007 году. Изучены пути достижения баланса экономических, социальных, экологических и политических аспектов развития страны как основы повышения качества жизни и обеспечения ее конкурентоспособности в долгосрочной перспективе. Рассмотрены экономические, социальные, экологические аспекты устойчивого развития. Исследованы основные пути повышения устойчивости АПК: индустриализация, модернизация, строительство инфраструктуры, совершенствование государственного регулирования и создание конкурентных преимуществ.